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HGPRGDel:生长耦合基因删除设计的GPR感知学习协议论文

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AI 综述

Ziwei Yang 与 Takeyuki Tamura 在 arXiv 发布 HGPRGDel 协议论文(arXiv:2610.37478),该协议通过显式表示基因-蛋白-反应(GPR)逻辑,学习并排序代谢工程中生长耦合生产的基因缺失优先级。 在 e_coli_core、iMM904 和 iML1515 三个模型上,该协议在所评估学习配置中取得最高 macro-F1 和 AUC,其排序平均以少于基线方法的基因检验量回收 MetNetComp 参考缺失基因的 90%。作者称这是面向各目标代谢物的可复现生长耦合基因删除设计协议。

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报道时间线

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10月28日
  1. arXiv cs.AI
    HGPRGDel:面向生长耦合基因缺失设计的 GPR 感知学习与排序方法

    研究者提出 HGPRGDel 协议,通过显式表示基因-蛋白-反应(GPR)逻辑,学习并排序代谢工程中生长耦合生产的基因缺失优先级。在 e_coli_core、iMM904 和 iML1515 三个模型上,该协议在所评估学习配置中取得最高 macro-F1 和 AUC,其排序以少于基线方法的基因检验量平均回收 MetNetComp 参考缺失基因的 90%。

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