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AI引导空间蛋白质组学揭示TNBC复发相关特征

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AI 综述

Yesung Cho 等研究者在 arXiv 发表论文,开发了一种结果导向的 AI 引导深度视觉蛋白质组学框架:先用 AI 生成复发风险热图来引导组织采样,再用基于质谱的空间蛋白质组学分析三阴性乳腺癌(TNBC)。 在 156 名患者中,同一肿瘤内高风险与低风险区域共存且特征各异:高风险区域富集有丝分裂程序,低风险区域与免疫和抗原呈递相关。研究还得到一组 13 蛋白组合预后标志物。 作者称,该蛋白组合在扩大的 TNBC 队列中可显著区分高复发与低复发患者,对应的转录组评分在 METABRIC 数据集中呈类似趋势;将蛋白组合与 H&E 图像风险评分结合后,区分能力提升,C-index 从 0.679 升至 0.739,5 年时间依赖性 AUC 从 0.675 升至 0.770。

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10月26日
  1. arXiv cs.AI
    AI 引导的深度视觉蛋白质组学揭示三阴性乳腺癌复发相关的形态-分子特征

    研究者开发了一种结果导向的 AI 引导深度视觉蛋白质组学框架,利用复发风险热图引导组织采样和基于质谱的空间蛋白质组学,分析三阴性乳腺癌(TNBC)。在 156 名患者中,肿瘤内高风险与低风险区域共存且特征各异,高风险区域富集有丝分裂程序,低风险区域与免疫和抗原呈递相关。

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