MUSS:单细胞基因调控多尺度序列模型
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MUSS:单细胞基因调控多尺度序列模型
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AI 综述
Kangjie Zheng 等在 arXiv 发布论文,提出基于 DNA 序列的单细胞基因调控多尺度模型 MUSS。该模型用冻结的预训练序列编码器从 DNA 提取 peak 与基因级表示,通过 peak 自注意力与距离偏置的 peak-gene 交互进行整合,并经 peak masked 语言建模以及 scATAC-seq 与 scRNA-seq 配对数据训练,同时保留 DNA 级与细胞级分辨率。 代码、数据集和模型检查点已公开提供。
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最新进展11月6日 13:00
MUSS:基于序列的单细胞基因调控多尺度模型报道时间线
沿着报道,了解事件的不同侧面。
11月6日
- arXiv cs.AIMUSS:基于序列的单细胞基因调控多尺度模型
MUSS 是一个基于 DNA 序列的单细胞基因调控多尺度模型,用冻结的预训练序列编码器从 DNA 提取 peak 与基因级表示,并通过 peak 自注意力与距离偏置的 peak-gene 交互整合,经 peak masked 语言建模和 scATAC-seq 与 scRNA-seq 配对数据训练。
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