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28个分子嵌入模型评测:多数不及经典ECFP指纹

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AI 综述

Mateusz Praski 等人在一项新研究中,用统一的分层贝叶斯 Bradley-Terry 统计检验框架,评测了 28 个预训练分子嵌入模型在 25 个分类数据集上的分子表示学习能力。结果发现,除 CheMeleon 外,所有神经模型都未能超越经典的 ECFP count 指纹,CheMeleon 是唯一被评为更优的模型。 基于 scaffold 交叉验证的外部检验也未显示哪类嵌入有确定优势。研究团队建议,在新的 QSAR/QSPR 研究中同时评估 ECFP 指纹和 CheMeleon 嵌入。

AI 根据报道生成 · 1 小时前更新

报道时间线

沿着报道,了解事件的不同侧面。

11月5日
  1. arXiv cs.AI
    基准测试预训练分子嵌入模型的分子表示学习能力

    一项新研究在统一框架下用分层贝叶斯 Bradley-Terry 统计检验评估了 28 个分子嵌入模型在 25 个分类数据集上的表现。结果发现除 CheMeleon 外所有神经模型都未能超越经典 ECFP count 指纹,而基于 scaffold 交叉验证的外部检验也未显示哪类嵌入有确定优势。

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